作为重要的生物资源，农业废弃物蕴含着巨大的能源及丰富的营养物质。但目前绝大多数农业废弃物被随意丢弃或者直接焚烧排放，使部分“资源”变为“污染源”。因此，如何将农业废弃物变“废”为“宝”，消除环境污染，改善农村生态环境，就成为重要课题。
食用菌是指可供人们食用的一类大型真菌，在物质循环过程中，不仅充当物质的还原者，又是对人类有贡献的次级生产者。按照循环农业的理念，食用菌产业与种植业、养殖业等有机结合，实现物质与能量的循环转化，对于提高农业废弃物利用的价值和效率，改善农业生态环境，降低农业生产成本等具有非常重要的意义。
变“废”为“宝”
中国是世界食用菌生产的第一大国，根据中国食用菌协会统计，1978年我国食用菌产量（鲜菇）为5.8万吨，到2010年已达到2201万吨以上，总产值超过1000亿元。目前，全国约有1000多个食用菌专业种植村、500多个基地县、100多个亿元产值基地县、2000多家生产企业，食用菌总产值仅次于种植业中的粮、棉、油、果、菜，超过茶叶和蚕桑。
随着食用菌产业和科技发展，食用菌栽培新型原料不断开发，农、林、牧废弃物，如稻草、高粱秸、玉米芯、棉柴、酒渣、豆腐渣以及各类畜禽粪便等均是食用菌生产的主要原料。
如人工栽培平菇，以玉米芯、木屑、棉籽壳等为原料，生物效率高达100%——150%；香菇、木耳、金针菇等以木屑为主要原料，适当配比棉籽壳、玉米芯、甘蔗渣等，生物学效率达70%——100%；草菇、双孢蘑菇等草腐菌以稻草、麦秸、玉米秸和牛粪等废弃物为主要原料，生物学效率达30%——40%。
可见，食用菌生产是将农林牧业废弃物转化成可供人们食用的优质高蛋白食品的重要新途径。
利用途径
根据中国食用菌2010年计算的数据，我国食用菌菌渣总量3000万吨以上。生产食用菌之后的废弃物菌渣，不仅可为动植物提供营养丰富的饲料和优质有机肥，也可作为二次栽培食用菌的原料，从而实现有机物质多次反复循环和利用。
食用菌废弃物中含有丰富的菌体蛋白、多种代谢产物及未被充分利用的营养物质，是较好的堆肥原料。如双孢蘑菇菌渣经堆肥处理后用作水稻基肥，与当地常规施肥方式相比增产20.55%，与不施肥处理相比增产44.18%。
在食用菌菌丝体的生长过程中，随着酶解反应的完成，副产品中木质素降解了30%，粗纤维降解了50%，粗蛋白由原来的2%——3%提高到10.03%——17.43%，氨基酸含量为0.5%——0.6%，特别是含有多种禽畜体内不能合成的，一般饲料中又缺乏的必需氨基酸和菌类多糖。因此，栽培食用菌的下脚料又是一种很好的菌糠饲料。
另外，菌渣还可用作燃料。将出菇后的食用菌废弃物晒干保藏，用于菌种培养基和培养料的灭菌燃料，已在生产中广泛应用。利用菌渣还可发展沼气，河南西峡县是食用菌生产大县，目前已发展沼气5000户，每年有5000吨菌渣投入沼料使用。
在环境治理方面，食用菌也可作为生态环境修复材料。例如，菇渣中含有大量的漆酶、多酚氧化酶以及过氧化物酶等多种降解酶类，这类酶不仅可以降解木质素，还能有效地降解萘、菲、吡等多环芳烃类的化合物。
